حصل الدكتور محمد جناحي على بكالوريوس الطب والجراحة من جامعة الملك فيصل بالمملكة العربية السعودية، كما حصل على تدريب الإقامة في مستشفى سانت لوك وروزفلت في نيويورك، الولايات المتحدة الأميركية بين عاميّ 1993-1996، ثم تدريب الزمالة في أمراضالأطفال الإنتانية في جامعة ومستشفى روبرت وود جونسون في نيوجيرسي، الولايات المتحدة الأمريكية منبين عاميّ 1996-1999. عام 1997، حصل الدكتور جناحي على شهادة البورد الأميركي في طب الأطفال.

شغل منصب رئيس قسم طب الأطفال في مؤسسة حمد الطبية منذ نوفمبر 2005؛ ورئيس قسم الأمراض المعدية لدى الأطفال منذ العام 1999؛ ونائب رئيس قسم طب الأطفال في سدرة للطب، والمدير الطبي للعيادات الخارجية. اضطلع بمعالجة
الأطفال مرضى الذين يعانون من أمراض إنتانية مختلفة على مدار الـ 19 عاماً الماضية. كما شغل د. جناحي منصب عضو هيئة تدريس معتمد في كلية طب وايل كورنيل الطبية في قطر، كأستاذ مشارك في طب الأطفال السريري.